PRRS病毒株毒力变化很大。低毒株可以引起猪群无临床症状的流行或者地方性流行。而强毒株能够引起严重的临床疾病，通常表现为食欲减退、发热、呼吸困难、末梢皮肤充血或发绀、母猪繁殖障碍以仔猪断奶前后呼吸困难、发育不良、死亡率增加等；该病潜伏期通常为2周；由于年龄、性别和猪群免疫状态、病毒毒力强弱、猪场饲养管理水平及气候条件等因素的不同，感染猪临床症状也不同；有混合或继发感染的情况下症状表现及死淘损失更加严重。

    1．繁殖母猪

    急性发病后的主要表现是发热、精神沉郁、食欲减退或废绝、嗜睡、咳嗽、不同程度呼吸困难、间情期延长或不孕、在末梢部位（耳部、鼻盘、乳腺、阴门等）的皮肤有不同程度的充血或发绀；在急性期有1%~3%的母猪可能出现流产，流产一般发生在妊娠第21~109d。急性病例发作约1周后，因为病毒通过胎盘传播，疾病进入第二阶段，主要表现是妊娠后期繁殖障碍，这一阶段可延续1~4个月。在第二阶段，妊娠110~108d的母猪，有5%~80%可能发生繁殖障碍，大多数繁殖障碍为早产，但也可出现妊娠足月或超出妊娠期的仔猪，或者出现流产；所产窝中有不同数量的正常仔、弱小仔、死胎、部分或完全木乃伊胎儿。在产不正常胎儿的母猪中，围产期的死亡率可为1%~2%；这些母猪再次用于繁殖，一般都会出现再次发情推迟且怀孕率低，加之流产损失、再发情的不规律和母猪不孕等，可导致整个繁殖周期中产仔率明显降低。

    人工接种妊娠84~93d后的母猪时，潜伏期为2~4d，继之出现呼吸系统症状和皮肤颜色的改变（如耳尖发紫）等，于感染后6~12d可以观察到该母猪的流产现象。

    2．公猪

    在急性发作的第一阶段，除厌食、精神沉郁、呼吸道临床症状外，公猪可能缺乏性欲和不同程度的精液质量降低；精液变化出现于病毒感染后2~4周，表现为运动能力下降和顶体缺乏，可在精液中检测到PRRSV。尽管公猪的PRRS病毒血症对受胎的影响还不清楚，但精液是PRRSV的重要传播方式之一。

    3．哺乳仔猪

    在母猪表现繁殖障碍的1~4个月期间，弱胎和正常胎儿的断奶前死亡率都高（可达60%）。几乎所有早产弱猪，在出生后的数小时内死亡。其余的猪在出生后的第一周死亡率最高，并且死亡可能延续到断奶和断奶以后。哺乳仔猪症状主要表现为精神沉郁、食欲不振、消瘦、外翻腿姿势、发热、呼吸困难和球结膜水肿（有人认为这是3周龄以下仔猪发生PRRS的特征表现之一，具有“诊断意义” ）。英国报道有PRRS导致持续水泻（抗生素治疗无效），也有报道感染仔猪出现震颤或划浆运动、前额轻微突起、血小板减少（导致脐部、注射部位、剪尾后出血）以及贫血等症状。

    4．断奶仔猪和生长育肥猪

    断奶仔猪可表现厌食、精神沉郁、呼吸症状、皮肤充血或发绀、皮毛粗糙、发育迟缓及同群个头差异大等。断奶仔猪单一的PRRSV感染时，咳嗽不是常见症状；育肥猪和老龄猪受PRRSV感染影响较小，通常仅出现短时间的食欲不振、轻度呼吸系统症状及耳朵等末梢皮肤发绀现象。但在病程后期，常常由于多种病原的继发性感染（败血性沙门氏菌、链球菌性脑膜炎、支原体肺炎、增生性肠炎、萎缩性鼻炎、大肠杆菌病、疥螨等）而导致病情恶化、死亡率增加。

    5．高致病性猪蓝耳病

    与经典猪蓝耳病比较，高致病性猪蓝耳病的主要特征是发病猪出现41℃以上持续高热；发病猪不分年龄段均出现急性死亡；仔猪出现高发病率和高死亡率，发病率可达100%死亡可达50%以上，母猪流产率可达30%以上。临床主要表现为发烧、厌食或不食；耳部、口鼻部、后躯及股内侧皮肤发红、淤血、出血斑、丘疹、眼结膜炎、咳嗽、喘等呼吸道症状；后躯无力、不能站立或摇摆、圆圈运动、抽搐等神经症状；部分发病猪呈顽固性腹泻。