1.根瘤菌是活的微生物，适于生长在湿润的中性及微碱性土壤中，应避免阳光直射下存放。
2.不能与杀虫剂、杀菌剂、除草剂混合使用，已拌种根瘤菌的种子不能与生石灰或大量浓厚肥料接触，以免杀死根瘤菌。
3.播种化学方法处理过的种子时，开沟撒施根瘤菌比直接拌种效果更好。
4.根瘤菌具有专一性，不同品种牧草所用的根瘤菌剂不同。
